28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3106 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  243  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  45 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  35.94 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 73 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  41.82 
 
 		 264 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  24.79 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2913  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.37 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 140 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  31.75 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  25.71 
 
 		 227 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2266  helix-turn-helix domain protein  30.19 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0639842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>