98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0347 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  100 
 
 
245 aa  494  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  78.72 
 
 
241 aa  378  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  72.15 
 
 
245 aa  343  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  59.83 
 
 
494 aa  294  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  52.52 
 
 
504 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  41.7 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  40.08 
 
 
253 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  35.8 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  30.8 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  30.36 
 
 
258 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.3 
 
 
243 aa  105  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  32.14 
 
 
240 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  31.02 
 
 
251 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  30.2 
 
 
254 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  29.75 
 
 
240 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  29.55 
 
 
548 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  31.48 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  26.21 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 
243 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  29.2 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  28.86 
 
 
529 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  27.19 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  27.12 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  29.32 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  29.55 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  26.32 
 
 
231 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  26.85 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  27.19 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  27.31 
 
 
329 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  24.68 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  25.51 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  22.55 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  24.8 
 
 
325 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.67 
 
 
325 aa  62  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  25.35 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.02 
 
 
355 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.83 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.36 
 
 
331 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  23.42 
 
 
332 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  26.63 
 
 
336 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3526  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  22.87 
 
 
249 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  27.54 
 
 
336 aa  52.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  26.52 
 
 
367 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1705  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  22.48 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  27.05 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  22.48 
 
 
330 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.61 
 
 
354 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.68 
 
 
355 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  26.23 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  26.44 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  22.78 
 
 
387 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  25.11 
 
 
348 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.58 
 
 
353 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.79 
 
 
355 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
328 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  27.48 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  22.96 
 
 
353 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  24.49 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.47 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.12 
 
 
333 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  24.26 
 
 
391 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  24.44 
 
 
392 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  21.6 
 
 
359 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  21.6 
 
 
359 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  21.6 
 
 
359 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1328  hypothetical protein  27.12 
 
 
526 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0459237  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  23.24 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.98 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  23.78 
 
 
391 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  25.93 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  34.67 
 
 
595 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  29.06 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1132  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1335  histidinol-phosphate phosphatase  22.22 
 
 
417 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0371324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  26.6 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  22.87 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0800  nucleotidyl transferase  20.57 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  24.77 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0481  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  23.41 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0151475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.47 
 
 
493 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  22.28 
 
 
351 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  22.67 
 
 
397 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  22.95 
 
 
399 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  33.33 
 
 
590 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.71 
 
 
357 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  24.29 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  20 
 
 
359 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1423  hypothetical protein  24.48 
 
 
259 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0459324  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0569  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  20.18 
 
 
274 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.706557  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3106  hypothetical protein  23.89 
 
 
506 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0591  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  22.7 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.157461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.65 
 
 
354 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  20.69 
 
 
243 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  23.69 
 
 
248 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2183  UDP-glucose pyrophosphorylase  26.12 
 
 
289 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1116  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
238 aa  42  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.267224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>