19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0319 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  46.15 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  41.88 
 
 
319 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  43.53 
 
 
311 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  40.2 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  33.76 
 
 
299 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  36.19 
 
 
322 aa  185  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  35.13 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  31.27 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  29.55 
 
 
307 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  29.21 
 
 
313 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  27.38 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  30.23 
 
 
304 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  25.81 
 
 
309 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  24.14 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  27.36 
 
 
1746 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  26.17 
 
 
1059 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  25.12 
 
 
1597 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  21.82 
 
 
1708 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>