66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3141 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3141  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5540  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  70.21 
 
 		 359 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.0244683 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  70.21 
 
 		 359 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1872  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.33 
 
 		 348 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137932  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1275  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.33 
 
 		 348 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  0.806138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1198  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.33 
 
 		 348 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.33 
 
 		 348 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.33 
 
 		 348 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000246247  hitchhiker  0.00945293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4443  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.14 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2006  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.54 
 
 		 348 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00873285  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0221  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.54 
 
 		 348 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.54 
 
 		 348 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2060  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.54 
 
 		 348 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000298499  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1766  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.12 
 
 		 354 aa  140  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0961431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.14 
 
 		 370 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20200  transposase  49.64 
 
 		 378 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.12815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  53.51 
 
 		 402 aa  130  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.54 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04230  transposase  51.75 
 
 		 402 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.389305  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 		 363 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11860  Transposase IS116/IS110/IS902 family  55.68 
 
 		 356 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3415  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.04 
 
 		 175 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2085  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44 
 
 		 364 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000256  normal  0.0160957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2255  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44 
 
 		 364 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000526829  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.04 
 
 		 297 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.518265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.4 
 
 		 350 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2861  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.19 
 
 		 422 aa  80.5  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437077  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.06 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.06 
 
 		 352 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  36.22 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10812  IS1547 transposase  36.22 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3417  hypothetical protein  44.26 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2305  hypothetical protein  54.55 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.876507  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0159  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.45 
 
 		 343 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1021  hypothetical protein  25.45 
 
 		 343 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  28.79 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1284  hypothetical protein  23.53 
 
 		 333 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.159965 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4269  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 		 403 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3501  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 		 403 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2824  transposase IS111A/IS1328/IS1533  27.27 
 
 		 403 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6004  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 335 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 335 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1379  hypothetical protein  24.32 
 
 		 342 aa  44.7  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.86 
 
 		 403 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2425  transposase IS111A/IS1328/IS1533  31.18 
 
 		 399 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.05 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.05 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.05 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  26.05 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6871  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.15 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1185  transposase IS111A/IS1328/IS1533  25.49 
 
 		 412 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.723874  normal  0.294088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1831  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.11 
 
 		 399 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0169  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.11 
 
 		 399 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00419214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2736  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.11 
 
 		 399 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>