66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0028 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0028  putative DNA methylase  100 
 
 		 261 aa  542  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0008  hypothetical protein  97.14 
 
 		 140 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0048  hypothetical protein  97.14 
 
 		 140 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151827  normal  0.011105 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0056  hypothetical protein  96.43 
 
 		 140 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000369581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0004  hypothetical protein  95.71 
 
 		 140 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  98.28 
 
 		 227 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  96.55 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  93.1 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  90.52 
 
 		 227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  88.79 
 
 		 225 aa  235  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0064  hypothetical protein  77.87 
 
 		 123 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0498058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  58.18 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  59.09 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.26 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3720  DNA modification methylase-like protein  61.39 
 
 		 131 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  49.61 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.76 
 
 		 225 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.91 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  53.64 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.73 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.69 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.82 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  34.38 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.14 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.25 
 
 		 874 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  27.84 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.12 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  26.98 
 
 		 389 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  26.8 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  26.8 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.64 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.33 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.72 
 
 		 348 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  26.8 
 
 		 349 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  26.8 
 
 		 349 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  26.8 
 
 		 349 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  27.66 
 
 		 391 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.33 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.37 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.84 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.17 
 
 		 597 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  25.77 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.39 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.68 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  25.77 
 
 		 349 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.94 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  22.73 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.73 
 
 		 377 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  22.73 
 
 		 377 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.56 
 
 		 376 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.56 
 
 		 376 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.3 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  21.58 
 
 		 368 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  31.18 
 
 		 459 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  23.48 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.42 
 
 		 382 aa  42.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  32.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  32.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  32.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  32.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  32.35 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2937  DNA methylase N-4/N-6  25.89 
 
 		 329 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000597198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.21 
 
 		 262 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.3 
 
 		 266 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.37 
 
 		 372 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  23.81 
 
 		 378 aa  42  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>