9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0048 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0048  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151827  normal  0.011105 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0056  hypothetical protein  96.43 
 
 
140 aa  274  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000369581  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0028  putative DNA methylase  97.14 
 
 
261 aa  273  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.412045  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0004  hypothetical protein  95.71 
 
 
140 aa  273  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0008  hypothetical protein  95.71 
 
 
140 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0064  hypothetical protein  79.51 
 
 
123 aa  193  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0498058 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0045  hypothetical protein  30.17 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200778  normal  0.0427856 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0052  hypothetical protein  29.57 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000878255  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0011  hypothetical protein  28.33 
 
 
144 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>