243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2937 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2937  DNA methylase N-4/N-6  100 
 
 
329 aa  686    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000597198  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  62.54 
 
 
326 aa  418  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0925  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  72.49 
 
 
294 aa  346  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.171639 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.45 
 
 
258 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.29 
 
 
239 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  31.36 
 
 
389 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.8 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.41 
 
 
359 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  27.95 
 
 
377 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  27.95 
 
 
386 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.56 
 
 
377 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.41 
 
 
380 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.63 
 
 
379 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.49 
 
 
376 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  29.66 
 
 
368 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  29.66 
 
 
372 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.66 
 
 
372 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.66 
 
 
372 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.51 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  28.81 
 
 
367 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  28.21 
 
 
380 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  27.38 
 
 
377 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.01 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  27.41 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.14 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.94 
 
 
368 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.78 
 
 
369 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.85 
 
 
369 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  29.66 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.97 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.78 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.83 
 
 
367 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.11 
 
 
367 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27 
 
 
389 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.54 
 
 
376 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  27.12 
 
 
377 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.71 
 
 
373 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  25.52 
 
 
372 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  27.85 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  27.8 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  26.58 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  27.97 
 
 
270 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.58 
 
 
396 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  28.51 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2243  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.12 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000134525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.98 
 
 
273 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.98 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  26.87 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.42 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.95 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.93 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0719  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.43 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.04 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  26.12 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.16 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.97 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.34 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  27.39 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.34 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.34 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.93 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  26.75 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.75 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.75 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.75 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  26.75 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  26.75 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  26.75 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  26.34 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.34 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.34 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.34 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.92 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.396214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.35 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.58 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.1 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.68 
 
 
286 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.71 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.34 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2756  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.54 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  26.46 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.85 
 
 
294 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  26.46 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  26.46 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  26.46 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  26.46 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  26.46 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  26.34 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.19 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  26.46 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.15 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  24.62 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.62 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.23 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.62 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.25 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  26.07 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  23.27 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  26.03 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.59 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>