More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1539 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  83.6 
 
 		 439 aa  749    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1539  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  100 
 
 		 439 aa  899    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.664121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  68.81 
 
 		 440 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1253  malate dehydrogenase  65.53 
 
 		 438 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0778  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  64.45 
 
 		 439 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2106  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  62 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3637  malate dehydrogenase  65.55 
 
 		 439 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0625695  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  61.96 
 
 		 759 aa  531  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.71 
 
 		 757 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  62.38 
 
 		 773 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  63.25 
 
 		 771 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  60.52 
 
 		 751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  60 
 
 		 766 aa  517  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  63.01 
 
 		 771 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  59.35 
 
 		 780 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  59.35 
 
 		 779 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  58.23 
 
 		 757 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  63.48 
 
 		 771 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  59.81 
 
 		 752 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  59.86 
 
 		 749 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  57.24 
 
 		 752 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  56.59 
 
 		 771 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  61.37 
 
 		 753 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.27 
 
 		 755 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  59.86 
 
 		 752 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  59.39 
 
 		 749 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  61.54 
 
 		 758 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  62.03 
 
 		 751 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  57.89 
 
 		 761 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  61.54 
 
 		 758 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  59.95 
 
 		 763 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  62.35 
 
 		 764 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  58.81 
 
 		 760 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  61.76 
 
 		 753 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  57.86 
 
 		 783 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  58.81 
 
 		 759 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  58.81 
 
 		 751 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  59.05 
 
 		 752 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  60.15 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  61.15 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  60.15 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  58.88 
 
 		 749 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  60.4 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  60.9 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  59.9 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  60.15 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  59.86 
 
 		 761 aa  484  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  59.15 
 
 		 422 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  59.15 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  59.15 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3014  malic enzyme  59.2 
 
 		 751 aa  483  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  58.64 
 
 		 751 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  56.9 
 
 		 762 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  60.77 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  59.43 
 
 		 763 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  59.4 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  57.38 
 
 		 754 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  55.94 
 
 		 756 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  58.02 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  56.94 
 
 		 754 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  55.71 
 
 		 756 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  55.64 
 
 		 754 aa  475  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  57.73 
 
 		 765 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  59.43 
 
 		 763 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  57.61 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  58.39 
 
 		 749 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  55.71 
 
 		 756 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  55.71 
 
 		 756 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  55.71 
 
 		 756 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  55.48 
 
 		 756 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  60.14 
 
 		 752 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  58.85 
 
 		 749 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  58.81 
 
 		 751 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  57.25 
 
 		 756 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  59.4 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  60.33 
 
 		 754 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  56.49 
 
 		 776 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  59.28 
 
 		 758 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  55.48 
 
 		 756 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  58.85 
 
 		 764 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  56.76 
 
 		 756 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  56.76 
 
 		 756 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  56.76 
 
 		 773 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  56.76 
 
 		 756 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  60.33 
 
 		 754 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  56.76 
 
 		 756 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  56.76 
 
 		 756 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  57.18 
 
 		 773 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  56.76 
 
 		 756 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  56.76 
 
 		 756 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  60.82 
 
 		 757 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  57.87 
 
 		 775 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  57.79 
 
 		 759 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  57.42 
 
 		 777 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  54.1 
 
 		 769 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.31 
 
 		 759 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  57.42 
 
 		 769 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  54.94 
 
 		 764 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  54.31 
 
 		 761 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  55.56 
 
 		 760 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>