More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3637 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1253  malate dehydrogenase  84.86 
 
 		 438 aa  730    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3637  malate dehydrogenase  100 
 
 		 439 aa  888    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0625695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  66.74 
 
 		 440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0778  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  70.55 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2106  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  68.3 
 
 		 436 aa  584  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  65.6 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1539  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  64.45 
 
 		 439 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.664121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.23 
 
 		 757 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  60.43 
 
 		 755 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  59.02 
 
 		 783 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  62.41 
 
 		 771 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  59.38 
 
 		 752 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  62.17 
 
 		 771 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  58.94 
 
 		 752 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  61.69 
 
 		 773 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  58.74 
 
 		 749 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  59.28 
 
 		 779 aa  496  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  58.5 
 
 		 780 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  58.75 
 
 		 777 aa  495  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  57.66 
 
 		 761 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  58.25 
 
 		 779 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  60.19 
 
 		 758 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  58.5 
 
 		 749 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  58.7 
 
 		 756 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  62.41 
 
 		 771 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  60.19 
 
 		 758 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  54.93 
 
 		 771 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  57.97 
 
 		 765 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  57.55 
 
 		 752 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  59.18 
 
 		 758 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  57.89 
 
 		 756 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  58.21 
 
 		 756 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  56.59 
 
 		 766 aa  490  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  58.21 
 
 		 756 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  57.42 
 
 		 759 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  57.66 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  57.66 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  57.49 
 
 		 761 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  57.66 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  57.97 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  58.81 
 
 		 751 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  57.66 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  57.66 
 
 		 773 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  57.97 
 
 		 756 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  56.66 
 
 		 769 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  57.66 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  57.66 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  57.66 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  55.35 
 
 		 757 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  57.97 
 
 		 756 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  57.97 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  58.61 
 
 		 769 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  55.9 
 
 		 760 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  56.7 
 
 		 760 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  57.11 
 
 		 764 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  58.84 
 
 		 752 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  56.94 
 
 		 760 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  59.76 
 
 		 749 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  57.66 
 
 		 773 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  59.12 
 
 		 764 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  56.39 
 
 		 777 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  56.76 
 
 		 764 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  54.55 
 
 		 754 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  56.17 
 
 		 764 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  55.8 
 
 		 776 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  56.83 
 
 		 763 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  57.35 
 
 		 759 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  57.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  58.06 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  57.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  57.79 
 
 		 779 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  57.71 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  58.45 
 
 		 752 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  57.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  57.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  57.35 
 
 		 759 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  60.33 
 
 		 757 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  57.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  57.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  57.21 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  57.11 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  59.62 
 
 		 754 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  57.46 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  57.21 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  57.11 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  57.87 
 
 		 763 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  57.11 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  57.11 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  57.11 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  57.99 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  57.46 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  54.25 
 
 		 751 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  59.95 
 
 		 751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  54.25 
 
 		 759 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  58.7 
 
 		 749 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  56.97 
 
 		 422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  59.66 
 
 		 749 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  57.38 
 
 		 761 aa  470  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  56.76 
 
 		 759 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>