More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3006 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  88.52 
 
 		 305 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  84.59 
 
 		 305 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  83.28 
 
 		 305 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  81.64 
 
 		 305 aa  524  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  87.54 
 
 		 321 aa  524  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  81.97 
 
 		 306 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  80.59 
 
 		 307 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  79.74 
 
 		 306 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  80.26 
 
 		 305 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  79.28 
 
 		 305 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  78.07 
 
 		 305 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  74.75 
 
 		 306 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  72.13 
 
 		 305 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  69.54 
 
 		 302 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  60.33 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  64.36 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  55.48 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  60.07 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  53.82 
 
 		 312 aa  322  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.18 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  57.82 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  53 
 
 		 302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  58.33 
 
 		 306 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  59.6 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 309 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  56.29 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  55.18 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  55.81 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  53.82 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  48.84 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.28 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  54.97 
 
 		 311 aa  298  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  56.15 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  55.92 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  58.8 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  55.12 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.92 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  54.79 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  57.95 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  52.82 
 
 		 307 aa  291  7e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  53.95 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  55.78 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  55.37 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  56.33 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  56.54 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  51 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.63 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  53.72 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  55 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  55.33 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  55.33 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.97 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  55.56 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  54.18 
 
 		 326 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  54.18 
 
 		 326 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  53.95 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  56.81 
 
 		 319 aa  285  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  53.07 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  54.15 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  55.7 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  53.02 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  52.68 
 
 		 300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  54.18 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  57.38 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  55.15 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  55.81 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  51.63 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  55.78 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  55.63 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  54.21 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  53.8 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  51.8 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  53.8 
 
 		 309 aa  280  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.84 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  50.33 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  54.58 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  54.82 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  53.59 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  52.53 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  54.28 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  54.7 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>