180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0019 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 83 bp  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  95.65 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 81 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t092  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0125  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104989  normal  0.132999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0125  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000725635  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0595639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000181545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>