255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0188 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0188  thymidylate synthase  100 
 
 		 276 aa  577  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1227  thymidylate synthase  82.97 
 
 		 276 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.101938  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0632  thymidylate synthase  60.64 
 
 		 282 aa  373  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  37.13 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  37.13 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  36.26 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  35.13 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  35.07 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  37.35 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  34.66 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  35.79 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  37.08 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  35.07 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  37.65 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  34.59 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  38.14 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  34.33 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  35.29 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  34.33 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  34.33 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  34.33 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  34.32 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  35.74 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  38.46 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  34.32 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  33.46 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  33.46 
 
 		 264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  38.53 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  35.63 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  32.1 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  34.56 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  33.58 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  37.65 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  32.04 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  36.86 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  36.02 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  35.18 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  35.59 
 
 		 264 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  34.78 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  33.95 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  32.47 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  36.02 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  35.63 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  33.58 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  32.84 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  36.67 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  32.71 
 
 		 264 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  33.85 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  35.42 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  35.93 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  31.32 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  34.65 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  35.93 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  31.95 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  35.42 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  34.41 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  36.1 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  35.22 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  33.96 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  33.77 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  32.09 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  31.72 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  35 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1260  thymidylate synthase  36.13 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000721083 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  31.72 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  34.01 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  32.84 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  34.41 
 
 		 267 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2032  Thymidylate synthase  33.45 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00060457  hitchhiker  0.0000668058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  33.77 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  30.26 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  33.77 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  35.59 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  35.5 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  35.47 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  31.34 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1631  thymidylate synthase  35.38 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  30.38 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1904  thymidylate synthase  34.8 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  32.1 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  32.1 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>