19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2496 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.06 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.06 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  39.6 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  38.61 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  30.87 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  36.46 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  36.84 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  32.67 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  33.33 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  30.51 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  41.43 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  38.37 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  38.37 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  32.05 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  33.88 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  32.17 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  34.31 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  22.52 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>