169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1655 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  100 
 
 		 323 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  58.73 
 
 		 317 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  59.05 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  58.73 
 
 		 317 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  50.48 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  33.97 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  32.06 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  33.65 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  35.11 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  33.95 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  32.48 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  31.43 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  34.49 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  33.13 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  33.44 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  34.49 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  31.83 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  30 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  29.97 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  35.65 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  29.06 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  35.14 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  33.54 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  33.23 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  29.73 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  33.01 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  32.5 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  35.76 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  33.76 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  30.82 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  34.31 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  30.82 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  30.82 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  32.92 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  30.35 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  29.71 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  29.71 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  33.13 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  29.78 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  31.87 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  29.78 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  31.25 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  29.78 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  30.03 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2680  glucokinase  34.31 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  29.47 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  29.28 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 642 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  31.96 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  32.82 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  29.45 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  29.02 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  30.58 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  33.97 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  32.62 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  30.3 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  32.62 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  32.62 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  28.21 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  29.97 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  29.45 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  30.09 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  32.4 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  29.56 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  26.53 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  26.53 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  32.92 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  28.57 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 642 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 642 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 642 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 616 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  35.44 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 642 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  31.86 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  31.53 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  31.94 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  31.29 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  31.02 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  31.19 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  32.24 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 638 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  26.43 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  31.55 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  30.33 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  29.66 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 638 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0803  glucokinase  33.13 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  26.28 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>