104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0628 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  61.4 
 
 		 274 aa  354  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  66.41 
 
 		 273 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  60 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  58.67 
 
 		 274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  58.33 
 
 		 282 aa  321  8e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  54.71 
 
 		 275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  54.71 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  55.27 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  56.8 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  60.73 
 
 		 272 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  56.97 
 
 		 281 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  52.92 
 
 		 282 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  56 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  55.35 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  58.94 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  52.36 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3127  extracellular solute-binding protein  54.83 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  51.84 
 
 		 275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  51.85 
 
 		 286 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  54.47 
 
 		 278 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2474  extracellular solute-binding protein family 1  55.98 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  46.55 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  45.93 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  48.77 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  47.45 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.46 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  48.67 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.09 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  46.09 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  48.67 
 
 		 269 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  49.03 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  44.64 
 
 		 301 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  46.07 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  46.61 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  45.69 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.06 
 
 		 271 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.13 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  45.14 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  47.56 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  45.69 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  43.84 
 
 		 285 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  46.01 
 
 		 294 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  44.24 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  45.9 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.96 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  45.49 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  44.53 
 
 		 270 aa  224  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  43.39 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.8 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  46.4 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  44.15 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  45.26 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  43.02 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  42.64 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  42.64 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  43.53 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  43.07 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  44.13 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  42.18 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  42.32 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  45.88 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  43.31 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  43.51 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1680  putative signal peptide protein  43.72 
 
 		 294 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  43.28 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3965  molybdate transport protein  46.86 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  44.77 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  43.92 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  41.43 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  43.71 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  42.4 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  42.35 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  42 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  37.46 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  38.18 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  42.41 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0521  ABC transporter tungsten-binding protein  37.05 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.144421  normal  0.476714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  40.62 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  42.17 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1525  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  37.7 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1892  putative tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein  37.96 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1711  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  37.3 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  40.96 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  35.32 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  35.74 
 
 		 636 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  32.72 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.36 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  35.77 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0645  binding protein, putative  37.94 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.55 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.36 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0824  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000536088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1482  tungstate ABC transporter permease  29.79 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0301515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>