More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1452 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 157 aa  329  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.45 
 
 		 144 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2792  protein tyrosine phosphatase  50.37 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  49.62 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.61 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  45.99 
 
 		 150 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.25 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.82 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.97 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.07 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.97 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.59 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  43.85 
 
 		 139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 		 143 aa  111  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  42.11 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  39.29 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  41.91 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  43.31 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.85 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 299 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  40.48 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.5 
 
 		 299 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  41.43 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 258 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.65 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  39.29 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  40.3 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  45.31 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.75 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  39.71 
 
 		 254 aa  97.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 255 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.97 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 		 146 aa  94.7  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  43.8 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 		 254 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  36.76 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  37.8 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  41.74 
 
 		 258 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.88 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.25 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  42.37 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 167 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.17 
 
 		 167 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.76 
 
 		 164 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 164 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  38.93 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  35.97 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  38.13 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.3 
 
 		 453 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  36.64 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  36.64 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  36.64 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  36.64 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  36.64 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  36.64 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>