More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1373 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0686  L-aspartate oxidase  64.71 
 
 		 527 aa  709    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.28562  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0526  L-aspartate oxidase  64.08 
 
 		 530 aa  691    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.761934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1829  L-aspartate oxidase  63.72 
 
 		 534 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0426262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1373  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 527 aa  1096    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588403  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1351  L-aspartate oxidase  61.48 
 
 		 528 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0806  L-aspartate oxidase  56.85 
 
 		 541 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0437  L-aspartate oxidase  47.69 
 
 		 534 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  48.09 
 
 		 534 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  44.72 
 
 		 538 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  44.72 
 
 		 538 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0787  L-aspartate oxidase  46.64 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.481111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  45.11 
 
 		 534 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0330  L-aspartate oxidase  45.54 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  44.11 
 
 		 533 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 525 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  41.97 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 		 538 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  41.71 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  43.13 
 
 		 531 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  42.58 
 
 		 534 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  41.44 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 		 538 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 		 534 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.1 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 		 531 aa  372  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  40.31 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.18 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 		 534 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 		 534 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  41.22 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.61 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 541 aa  372  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  41.7 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 538 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  41.76 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  41.27 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  41.14 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 		 545 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 537 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 		 563 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  40.57 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  40.27 
 
 		 537 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  41.27 
 
 		 540 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  40.57 
 
 		 552 aa  365  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  41.52 
 
 		 534 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.05 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  41.07 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  42.31 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 533 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  41.07 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  39.58 
 
 		 539 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  40.98 
 
 		 538 aa  365  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 		 543 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 		 537 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 		 537 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 		 537 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 541 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  41.07 
 
 		 540 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 		 537 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 		 537 aa  363  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 		 544 aa  363  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  41.07 
 
 		 540 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40.61 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 533 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  40.85 
 
 		 545 aa  363  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  41.29 
 
 		 538 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 534 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 546 aa  362  8e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  42.69 
 
 		 534 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 		 532 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 		 540 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  41.67 
 
 		 536 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>