51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2831 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  914    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  41.86 
 
 
232 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  32.17 
 
 
253 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  33.83 
 
 
265 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  34.65 
 
 
247 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  33.5 
 
 
247 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  33.99 
 
 
247 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  33 
 
 
247 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  33.17 
 
 
247 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  33.17 
 
 
247 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  33.17 
 
 
247 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  32.67 
 
 
247 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  32.67 
 
 
247 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  30.38 
 
 
480 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  31.78 
 
 
236 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  31.31 
 
 
236 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  32.16 
 
 
247 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  33.97 
 
 
247 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14990  putative anti-SigV factor  27.5 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.008664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1437  hypothetical protein  27.62 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  28.9 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  26.56 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  27.31 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  28.21 
 
 
271 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1046  hypothetical protein  40.86 
 
 
298 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000752842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  27.72 
 
 
201 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  25.95 
 
 
264 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  26.42 
 
 
215 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  33.9 
 
 
370 aa  57.4  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1580  hypothetical protein  35.85 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.77857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  24.26 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  27.45 
 
 
281 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  25.88 
 
 
281 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  23.42 
 
 
418 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  30.17 
 
 
361 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  35.09 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2311  hypothetical protein  26.72 
 
 
239 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  24.71 
 
 
248 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  28.8 
 
 
322 aa  47.4  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  24.14 
 
 
248 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  23.56 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  23.56 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  27.2 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  26.15 
 
 
281 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  30.95 
 
 
350 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.36 
 
 
315 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  22.16 
 
 
243 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  24.83 
 
 
239 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  22.73 
 
 
248 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  22.96 
 
 
251 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  21.64 
 
 
248 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>