More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0438 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
263 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0565837  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.1 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
263 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
255 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
241 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.397632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
257 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.983442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.89 
 
 
260 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03220  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.04 
 
 
394 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0856  ABC-type transport system, permease component  35.19 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.376745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
244 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00218262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
275 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0492  sulfonate/nitrate/taurine transport system permease protein  32.31 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218596  normal  0.461447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
242 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000270165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
267 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  28.23 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0340  putative sulfonate transport system permease protein  31.36 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
287 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  31.17 
 
 
263 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
264 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
278 aa  112  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.13 
 
 
252 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  30.04 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0211  ABC transporter permease  31.84 
 
 
243 aa  109  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000181791  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
272 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.95605  normal  0.544796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
265 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.58 
 
 
261 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
291 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  27.13 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
265 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.87 
 
 
266 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
275 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498901  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.63 
 
 
279 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
265 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
253 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  27.19 
 
 
274 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
273 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5824  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
271 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.371064  hitchhiker  0.00175636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.48 
 
 
260 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
273 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
274 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  28.57 
 
 
282 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
264 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
319 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  29 
 
 
279 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
263 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0219974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
275 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
302 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1465  ABC transporter permease  29.46 
 
 
251 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
264 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
265 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  26.73 
 
 
274 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
263 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  27.35 
 
 
301 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
260 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  30.64 
 
 
262 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  30.64 
 
 
262 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
253 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
253 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 
274 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
286 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  27.98 
 
 
274 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.85 
 
 
279 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
286 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
252 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  26.96 
 
 
282 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  26.96 
 
 
282 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
257 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 
286 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
258 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1737  ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 
251 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0444419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.02 
 
 
311 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
254 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
275 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
321 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  26.21 
 
 
275 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  26.21 
 
 
275 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  26.21 
 
 
275 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
248 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
320 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.51 
 
 
273 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
277 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
273 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
263 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>