More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1525 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  35.11 
 
 
246 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 
241 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
265 aa  122  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.78 
 
 
225 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  36 
 
 
224 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
221 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
213 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  34.12 
 
 
216 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.88 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  34.69 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.93 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  36.73 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.62 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  35.64 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.81 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.56 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  36.63 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 
217 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  38.2 
 
 
207 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
243 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.86 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  38.24 
 
 
238 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.39 
 
 
255 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  39.56 
 
 
210 aa  62.4  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
207 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.44 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.03 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  30.77 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  40 
 
 
205 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
239 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1133  methyltransferase type 11  26.25 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_002620  TC0410  hypothetical protein  34.21 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.404807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.66 
 
 
235 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
207 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
233 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  36.46 
 
 
242 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
204 aa  59.3  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.33 
 
 
213 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  36.61 
 
 
217 aa  58.9  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 
258 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  36.61 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.41 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
348 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  31.25 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  26.97 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.06 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>