202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0844 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  701    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  51.93 
 
 
338 aa  359  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  51.03 
 
 
335 aa  352  7e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  48.95 
 
 
335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  45.94 
 
 
325 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  46.2 
 
 
321 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  44.38 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  44.94 
 
 
336 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  43.26 
 
 
327 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  45.03 
 
 
324 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  42.81 
 
 
324 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  45.96 
 
 
295 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  43.08 
 
 
506 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  42.81 
 
 
320 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  43.95 
 
 
325 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  42.63 
 
 
321 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  45.06 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  43.89 
 
 
319 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  45.03 
 
 
323 aa  262  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  43.57 
 
 
321 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  43.07 
 
 
333 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  43.08 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  42.2 
 
 
321 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  42.63 
 
 
321 aa  256  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  41.69 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  41.69 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  41.69 
 
 
321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  41.67 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  42.39 
 
 
327 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  41.38 
 
 
321 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  42.01 
 
 
321 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  41.69 
 
 
321 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  40.79 
 
 
323 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  39.69 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  61.76 
 
 
180 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  39.36 
 
 
288 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  38.84 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  54.61 
 
 
160 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  35.17 
 
 
319 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  33.75 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  31.83 
 
 
321 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  29.69 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  31.1 
 
 
313 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  32.01 
 
 
282 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  31.71 
 
 
305 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  29.81 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  29.69 
 
 
315 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  34.19 
 
 
314 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  60.4 
 
 
101 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  38.12 
 
 
312 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  36.84 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  29.79 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  29.12 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  28.32 
 
 
316 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  30.56 
 
 
326 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  29.82 
 
 
289 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  37.3 
 
 
288 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  37.3 
 
 
288 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  36.76 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  30.8 
 
 
287 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  30.49 
 
 
264 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  51.43 
 
 
112 aa  119  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  33.61 
 
 
277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  35.16 
 
 
253 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  34.07 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  39.26 
 
 
251 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  34.21 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  37.36 
 
 
176 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  34.21 
 
 
241 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  50.55 
 
 
101 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  34.62 
 
 
181 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  34.69 
 
 
192 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  34.54 
 
 
190 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  34.76 
 
 
287 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  38.35 
 
 
250 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  37.59 
 
 
252 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  40.16 
 
 
241 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  30.57 
 
 
336 aa  99.4  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  30.23 
 
 
258 aa  99  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  27.64 
 
 
321 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  33.54 
 
 
236 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.8 
 
 
230 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  34.76 
 
 
236 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  35.88 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 
236 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  31.58 
 
 
224 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  32.51 
 
 
230 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  51.16 
 
 
97 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  36.76 
 
 
235 aa  92.8  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  38.46 
 
 
277 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  32.26 
 
 
230 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  32.26 
 
 
230 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  26.9 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  31.51 
 
 
233 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  29.63 
 
 
216 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  31.36 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  33.82 
 
 
239 aa  89.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  36.03 
 
 
221 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  34.53 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  48.72 
 
 
81 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>