29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0105 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  475  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  49.54 
 
 		 222 aa  251  7e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  48.88 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  50.69 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  47.89 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  45.85 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  46.79 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  36 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  40.8 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  36.27 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  34.59 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  29.93 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  26.76 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  25.12 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  26.89 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  31.16 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  30.5 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  26.95 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  30.71 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.86 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  30.47 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  26.28 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  26.24 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  27.34 
 
 		 169 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  27.27 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  25.32 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0722  hypothetical protein  29.92 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>