43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_241 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  69.4 
 
 		 514 aa  732    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  100 
 
 		 502 aa  1030    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  41.6 
 
 		 307 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  33.81 
 
 		 282 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  33.55 
 
 		 347 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  33.33 
 
 		 310 aa  127  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  36.75 
 
 		 309 aa  126  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  34.51 
 
 		 309 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  34.51 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  36.54 
 
 		 252 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  32.61 
 
 		 271 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  28.1 
 
 		 334 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  30.07 
 
 		 310 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  34.42 
 
 		 268 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  33.33 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  30.95 
 
 		 263 aa  89.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  29.84 
 
 		 471 aa  87.8  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  27.51 
 
 		 589 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  29.1 
 
 		 755 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  25.28 
 
 		 591 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  28.84 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1448  hypothetical protein  30.85 
 
 		 163 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0257949  hitchhiker  0.000320598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  31.03 
 
 		 159 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  24.58 
 
 		 278 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  26.16 
 
 		 293 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  28.74 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0035  hypothetical protein  35.44 
 
 		 186 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0921527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2287  hypothetical protein  31.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0140266  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  30.85 
 
 		 156 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2673  hypothetical protein  34.19 
 
 		 159 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1551  protein of unknown function DUF192  28.57 
 
 		 162 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1076  protein of unknown function DUF192  35.56 
 
 		 171 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.855452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  27.47 
 
 		 162 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2790  hypothetical protein  32.98 
 
 		 160 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0740551  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  22.67 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3244  protein of unknown function DUF192  30.34 
 
 		 181 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  29.41 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  30.1 
 
 		 155 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  28.72 
 
 		 163 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  35.06 
 
 		 169 aa  43.9  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  30.85 
 
 		 159 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>