22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_186 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  85.71 
 
 		 91 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  86.81 
 
 		 91 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  50.57 
 
 		 92 aa  105  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  49.45 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  50 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  51.69 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  48.31 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  50 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  55.26 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  46.91 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  46.34 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  45 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  44.87 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  42.31 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  46.38 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  40.24 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  25.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  54.05 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  27.85 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  32.91 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  34.18 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>