25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4164 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 113 aa  233  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  35.96 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  28.97 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  31.07 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  37.66 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  28.07 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  26.13 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  28.32 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  26.36 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  38.64 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6110  DNA polymerase beta subunit  28.04 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  53.49 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  31.86 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  33.63 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4231  nucleotidyltransferase  29.91 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00450243  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  29.07 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  27.59 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  34.67 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0468  DNA polymerase beta domain protein region  29.6 
 
 		 304 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>