24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2074 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1974  hypothetical protein  28.38 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000970389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  26.04 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  28.38 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  31.93 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  27.11 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  25.44 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  29.84 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3197  hypothetical protein  25.45 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00506023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  21.33 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0092  hypothetical protein  21.9 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  31.87 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  26.09 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  28.09 
 
 		 152 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  25.81 
 
 		 152 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  26.96 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0072  hypothetical protein  23.61 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0377393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  23.81 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  24.67 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  26.04 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  28.09 
 
 		 152 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>