73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0247 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  952    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  68.76 
 
 
498 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  55.62 
 
 
492 aa  544  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  54.25 
 
 
479 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  50.62 
 
 
480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  49.69 
 
 
473 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  43.24 
 
 
487 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  44.31 
 
 
493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  44.76 
 
 
478 aa  343  5e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  40.99 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  44.02 
 
 
472 aa  319  6e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  59.31 
 
 
239 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  32.51 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  32.21 
 
 
467 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  29.33 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  32 
 
 
467 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  27.41 
 
 
419 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  28.02 
 
 
418 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  28.06 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  28.66 
 
 
442 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  29.83 
 
 
569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  30.82 
 
 
445 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  30.82 
 
 
445 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  27.45 
 
 
473 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  27.94 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  27.96 
 
 
473 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  27.87 
 
 
434 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  29.07 
 
 
416 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  30.13 
 
 
445 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  29.34 
 
 
582 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  28.7 
 
 
593 aa  96.7  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  28.08 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  30.24 
 
 
579 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  30.84 
 
 
379 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  26.97 
 
 
593 aa  92.8  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  26.8 
 
 
436 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  29.71 
 
 
450 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  27.78 
 
 
580 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  29.35 
 
 
611 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  28.64 
 
 
580 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  27.78 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  27.39 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  32.91 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  31.5 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  29.17 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  30.19 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  24.63 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  28.22 
 
 
360 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  26.1 
 
 
357 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  29.8 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  26.2 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  25.77 
 
 
331 aa  61.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  28.26 
 
 
331 aa  60.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  31.51 
 
 
391 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  27.22 
 
 
348 aa  57.4  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  26.69 
 
 
352 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  23.88 
 
 
338 aa  53.5  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  30.77 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  28.82 
 
 
327 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  24.75 
 
 
360 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  23.66 
 
 
361 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  28.67 
 
 
369 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.02 
 
 
360 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.02 
 
 
360 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  25.28 
 
 
343 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  25.91 
 
 
335 aa  46.6  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  22.22 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  25.73 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  23.71 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  23.86 
 
 
346 aa  45.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2057  hypothetical protein  28.07 
 
 
330 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  25.44 
 
 
339 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  21.12 
 
 
441 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>