243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2997 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  100 
 
 
237 aa  495  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  68.16 
 
 
251 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  47.6 
 
 
233 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  47.03 
 
 
238 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  47.75 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  47.75 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  47.75 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  47.75 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  47.75 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  47.3 
 
 
242 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  46.15 
 
 
243 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  46.09 
 
 
233 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  46.52 
 
 
233 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  46.52 
 
 
233 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  46.52 
 
 
233 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  46.52 
 
 
233 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  45.34 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  44.92 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  46.19 
 
 
238 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  45.76 
 
 
238 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  45.76 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  45.85 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  46.22 
 
 
233 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  46.22 
 
 
233 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  46.22 
 
 
233 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  46.22 
 
 
233 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  43.48 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  44.93 
 
 
237 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  43.78 
 
 
236 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  43.48 
 
 
237 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  43.35 
 
 
236 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  43.35 
 
 
236 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  39.91 
 
 
236 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  51.96 
 
 
180 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  43.61 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 
231 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  37.82 
 
 
232 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  43.32 
 
 
232 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  37.07 
 
 
231 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  38.79 
 
 
238 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  38.79 
 
 
238 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  38.79 
 
 
238 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  37.77 
 
 
238 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  35.79 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  33.04 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  33.04 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  33.04 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  33.04 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  35.91 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  35.91 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  34.45 
 
 
226 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  37.56 
 
 
237 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  34.45 
 
 
226 aa  125  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  34.45 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  35.36 
 
 
228 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  36.87 
 
 
236 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  29.82 
 
 
228 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  37.56 
 
 
237 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  38.86 
 
 
212 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.45 
 
 
226 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  34.45 
 
 
226 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  37.5 
 
 
213 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  33.04 
 
 
226 aa  122  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  38.07 
 
 
236 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  37.06 
 
 
236 aa  121  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  34.45 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  38.34 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  33.97 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.91 
 
 
226 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  34.91 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  38.27 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  36.04 
 
 
224 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  38.34 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  38.34 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  32.61 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  35.23 
 
 
206 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  34.04 
 
 
243 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  38.3 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  44.53 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  44.53 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  39.68 
 
 
254 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  39.68 
 
 
254 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  43.88 
 
 
227 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
264 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  36.72 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  36.72 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  38.34 
 
 
235 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  39.43 
 
 
196 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  41.96 
 
 
211 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  33.33 
 
 
235 aa  111  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  43.17 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  43.17 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  35.94 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.17 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>