41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2574 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2574  transport-associated protein  100 
 
 		 179 aa  355  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  44.12 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  36.99 
 
 		 135 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  33.67 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  35.71 
 
 		 244 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  35.62 
 
 		 301 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  33.33 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  40 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  34.94 
 
 		 129 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  48 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  48 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  48 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  48 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  48 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  48 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  30.88 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  48 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  34.25 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  36.62 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  37.88 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  33.75 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  34.78 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  33.77 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  46 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  36.36 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  33.77 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  37.31 
 
 		 84 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  40 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  37.33 
 
 		 273 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  43.64 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  31.33 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  42.22 
 
 		 218 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  33.33 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  33.75 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  34.85 
 
 		 315 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  40 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  43.18 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  35.29 
 
 		 308 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  36.49 
 
 		 273 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3047  phospholipid-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 584 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>