More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2389 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  784    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 		 444 aa  349  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  41.44 
 
 		 895 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  40.83 
 
 		 912 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  42.28 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 472 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  42.35 
 
 		 426 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  42.35 
 
 		 426 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  42.86 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  42.61 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 420 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  38.99 
 
 		 905 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 438 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 438 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  42.09 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  42.09 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  42.09 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  42.09 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  42.63 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  38.02 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  37.83 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 425 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  37.87 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 		 443 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 420 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  38.99 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  38.14 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  32.35 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  40.91 
 
 		 917 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  33.82 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 413 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 439 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 453 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  43.65 
 
 		 893 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  41.77 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 422 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 428 aa  205  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  37.77 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  38 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  37.77 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 424 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  37.14 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  36.57 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  35.51 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  36.83 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  31.69 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  31.69 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  31.69 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  31.69 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  31.69 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  36.62 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  31.69 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  31.69 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  31.69 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  34.91 
 
 		 403 aa  163  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  32.73 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  33.16 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  34.47 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  36.36 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  35.67 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  35.67 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  35.61 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  31.68 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>