More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0781 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
414 aa  823    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  46.68 
 
 
390 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  44.33 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  40.42 
 
 
390 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 
390 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  43.31 
 
 
386 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  42.46 
 
 
385 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  37.11 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  36.02 
 
 
386 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.92 
 
 
392 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  37.14 
 
 
385 aa  219  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  38.08 
 
 
385 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  38.08 
 
 
385 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  38.8 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  37.13 
 
 
386 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  35.64 
 
 
394 aa  210  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 
405 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 
390 aa  209  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  38.26 
 
 
383 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  32.71 
 
 
400 aa  206  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 
372 aa  206  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  30.25 
 
 
397 aa  203  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  32.22 
 
 
514 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  34.74 
 
 
379 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
394 aa  199  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  31.68 
 
 
388 aa  197  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  34.9 
 
 
386 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  35.2 
 
 
409 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  31.15 
 
 
393 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  35.75 
 
 
383 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 
393 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  30.87 
 
 
393 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 
383 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  28.11 
 
 
389 aa  192  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  31.41 
 
 
393 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  35.45 
 
 
395 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 
393 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  36.27 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  30.6 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  32.39 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  35.86 
 
 
384 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  27.99 
 
 
399 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 
378 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  29.53 
 
 
521 aa  189  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  34.82 
 
 
395 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 
397 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  31.44 
 
 
387 aa  187  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  35.1 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
384 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  31.17 
 
 
383 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  32.25 
 
 
394 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  30.79 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  34.82 
 
 
393 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  31.41 
 
 
383 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  30.79 
 
 
383 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
390 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.56 
 
 
396 aa  179  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  35.42 
 
 
394 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  30.53 
 
 
383 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  30.08 
 
 
386 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10930  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  32.17 
 
 
405 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34112  unclonable  0.00000000328438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  32.99 
 
 
392 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  36.22 
 
 
394 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  28.94 
 
 
391 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 
393 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  30.53 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  28.68 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  30.26 
 
 
383 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  30.26 
 
 
383 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  34.35 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  34.35 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  29.47 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  33.92 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  33.25 
 
 
390 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 
383 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  29.74 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  30.15 
 
 
383 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  32.99 
 
 
390 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  37.02 
 
 
376 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  29.53 
 
 
383 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 
397 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 
412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  29.24 
 
 
390 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  33.57 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  32.84 
 
 
407 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  30.93 
 
 
402 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  30.93 
 
 
402 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  32.23 
 
 
390 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  33.92 
 
 
415 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  30.39 
 
 
390 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  28.9 
 
 
387 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  30.67 
 
 
402 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  30.75 
 
 
375 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  29.27 
 
 
400 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  28.76 
 
 
389 aa  160  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 
402 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>