19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4280 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  100 
 
 		 522 aa  1078    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  39.29 
 
 		 544 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  37.59 
 
 		 537 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  35.69 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  36.6 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.03 
 
 		 982 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1600  hypothetical protein  25.31 
 
 		 519 aa  90.1  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  21.35 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  25.45 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.3 
 
 		 1217 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  24.49 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1730  Ig domain protein  24.68 
 
 		 1170 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.07641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  24.12 
 
 		 1410 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  25.55 
 
 		 629 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  22.2 
 
 		 726 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  20.8 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  21.78 
 
 		 681 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  22.05 
 
 		 688 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1519  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1513 aa  43.5  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>