31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3416 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  100 
 
 		 131 aa  275  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  63.85 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  54.17 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  49.57 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  38.26 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  36.44 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  38.79 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  39.66 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  38.79 
 
 		 304 aa  83.6  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  37.4 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  34.88 
 
 		 312 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  36.45 
 
 		 315 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  39.42 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  34.48 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  36.79 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  35.65 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  34.78 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  35.04 
 
 		 317 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  38.1 
 
 		 313 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.65 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  31.3 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  35.34 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  32.99 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  33.91 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  33.86 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  30.25 
 
 		 309 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  29.91 
 
 		 310 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  28.32 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>