276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3228 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0235  alpha-glucan phosphorylase  54.43 
 
 		 554 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.400789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3228  alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 		 549 aa  1150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2105  alpha-glucan phosphorylase  55.56 
 
 		 550 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.669842  normal  0.393403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0308  a-glucan phosphorylase  53.02 
 
 		 544 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3551  alpha-glucan phosphorylase  54.44 
 
 		 567 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.266998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0535  alpha-glucan phosphorylase  46.4 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1452  alpha-glucan phosphorylase  45.86 
 
 		 520 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0467  alpha-glucan phosphorylase  45.68 
 
 		 520 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0370  alpha-glucan phosphorylase  45.3 
 
 		 520 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0980  alpha-glucan phosphorylase  43.34 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.490785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  37.45 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  35.5 
 
 		 535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  37.04 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  34.74 
 
 		 545 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  34.49 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  33.61 
 
 		 844 aa  297  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  34.3 
 
 		 690 aa  296  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  32.78 
 
 		 704 aa  294  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  32.1 
 
 		 703 aa  294  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  32.31 
 
 		 706 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  32.47 
 
 		 736 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  30.99 
 
 		 857 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  32.79 
 
 		 703 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  32.92 
 
 		 854 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  31.65 
 
 		 705 aa  286  9e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  31.48 
 
 		 737 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  31.43 
 
 		 706 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  32.61 
 
 		 823 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  31.64 
 
 		 853 aa  282  9e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  30.67 
 
 		 853 aa  282  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  33.44 
 
 		 832 aa  281  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  32.31 
 
 		 849 aa  279  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  30.67 
 
 		 871 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  32.43 
 
 		 835 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  32.13 
 
 		 854 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2234  alpha-glucan phosphorylases  32.26 
 
 		 561 aa  277  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  31.86 
 
 		 855 aa  276  5e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  33.28 
 
 		 570 aa  276  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  32.9 
 
 		 713 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  30.57 
 
 		 712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  31.26 
 
 		 719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  31.96 
 
 		 854 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  32.38 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  31.67 
 
 		 850 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  31.67 
 
 		 850 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  32.27 
 
 		 862 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  31.4 
 
 		 722 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  31.89 
 
 		 838 aa  272  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  30.49 
 
 		 851 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  32.2 
 
 		 854 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1811  alpha-glucan phosphorylases  29.86 
 
 		 862 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  30.52 
 
 		 1421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  32.03 
 
 		 850 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1098  alpha-glucan phosphorylase  31.17 
 
 		 856 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.27206  hitchhiker  0.000386148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  31.83 
 
 		 858 aa  266  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  31.03 
 
 		 877 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  30.66 
 
 		 849 aa  266  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  31.54 
 
 		 841 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  30.84 
 
 		 863 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  31.54 
 
 		 841 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  32.03 
 
 		 854 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  30.14 
 
 		 860 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  30.14 
 
 		 860 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  31.87 
 
 		 854 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  30.29 
 
 		 849 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3064  alpha-glucan phosphorylase  32.32 
 
 		 822 aa  264  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  30.19 
 
 		 855 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  31.88 
 
 		 850 aa  263  8e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  30.68 
 
 		 875 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  29.98 
 
 		 860 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  30.18 
 
 		 873 aa  262  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  29.82 
 
 		 848 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  30.84 
 
 		 856 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  29.71 
 
 		 881 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  30.81 
 
 		 854 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  31.85 
 
 		 693 aa  260  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  31.45 
 
 		 854 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  30.35 
 
 		 729 aa  259  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1436  alpha-glucan phosphorylase  31.8 
 
 		 850 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.702483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  30.63 
 
 		 858 aa  258  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  30.69 
 
 		 849 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  31.16 
 
 		 852 aa  257  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  31.86 
 
 		 842 aa  256  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  32.2 
 
 		 854 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  29.07 
 
 		 716 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  30.38 
 
 		 694 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  29.71 
 
 		 719 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  30.07 
 
 		 847 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  30.97 
 
 		 854 aa  253  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  30.46 
 
 		 570 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  30.32 
 
 		 861 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  29.82 
 
 		 872 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  29.87 
 
 		 875 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  28.94 
 
 		 860 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  29.97 
 
 		 855 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2997  glycogen phosphorylase  32.31 
 
 		 558 aa  250  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00491814 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  29.9 
 
 		 717 aa  250  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  30.46 
 
 		 855 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  29.32 
 
 		 863 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  29.13 
 
 		 863 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>