78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2882 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 342 aa  718    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  71.93 
 
 		 328 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  74.11 
 
 		 310 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  77 
 
 		 328 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  67.6 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  64.26 
 
 		 303 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  56.4 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  52.26 
 
 		 291 aa  325  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  50.34 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  43.56 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  42.22 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 		 267 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  42.37 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  40.61 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  26.72 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  28.12 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  28.79 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  27.34 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  27.91 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  27.13 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  27.06 
 
 		 253 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  26.36 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  26.92 
 
 		 251 aa  93.2  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  28.57 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  29.32 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  29.52 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  28.22 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  26.67 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  30.82 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.86 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  25.17 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  23.93 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  26.2 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  26.64 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  23.56 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  24.56 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  24.13 
 
 		 462 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  24.52 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  24.43 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  32.23 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  24.83 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  22.46 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 256 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.4 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  26.34 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  23.21 
 
 		 606 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  37.21 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  22.94 
 
 		 256 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  25.79 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  28.1 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  22.37 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0329  Aryldialkylphosphatase  27.03 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.369363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  23.79 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  22.61 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  22.22 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  26.95 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  23.44 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  24.4 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  25.27 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  26.92 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  27.03 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  28.46 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  26.52 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  23.29 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  28.99 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  26.15 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  25.16 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  25.16 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  25.28 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  24.51 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  24.06 
 
 		 258 aa  43.5  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  24.22 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  23 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  25 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  25.21 
 
 		 265 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  26.32 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  25.66 
 
 		 287 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>