190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2577 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.52 
 
 
306 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  47.27 
 
 
302 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  47.83 
 
 
312 aa  254  9e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  45.12 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.67 
 
 
336 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  43.05 
 
 
311 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  49.11 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  47.64 
 
 
310 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  45.05 
 
 
302 aa  225  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00640  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  43.35 
 
 
289 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  38.14 
 
 
319 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0953  putative D-cysteine desulfhydrase, DcyD  42.76 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  35.69 
 
 
318 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6027  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  42.97 
 
 
259 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581609  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.61 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  35.44 
 
 
307 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.58 
 
 
304 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1569  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.39 
 
 
299 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.209686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3733  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  36.11 
 
 
297 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2009  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  36.2 
 
 
297 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3802  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  35.23 
 
 
314 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2162  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  36.07 
 
 
312 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0392224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1541  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.68 
 
 
297 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.974247  normal  0.412213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2947  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  34.83 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.271855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1676  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  33.89 
 
 
314 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334967  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24190  putative 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.48 
 
 
310 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0268894  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3686  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  33.81 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  33.33 
 
 
312 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  33.33 
 
 
312 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2048  ACC deaminase/D-cysteine desulfhydrase family protein  34.48 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0600526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  32.32 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  28.81 
 
 
337 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  27.81 
 
 
331 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
331 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
331 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
331 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
331 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  27.15 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  27.15 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  27.72 
 
 
332 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_3183  predicted protein  28.96 
 
 
327 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0144015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  29.59 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  27.48 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  27.15 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  28.15 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  28.96 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  27.92 
 
 
337 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  28.25 
 
 
337 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  29.63 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  29.62 
 
 
340 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  31.29 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  29.17 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  29.45 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  28.82 
 
 
328 aa  89.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  29.11 
 
 
328 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  29.11 
 
 
328 aa  89  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  29.11 
 
 
328 aa  89  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  29.11 
 
 
342 aa  89  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  29.11 
 
 
328 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
328 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  27.49 
 
 
332 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  28.28 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  29.62 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  25.61 
 
 
333 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  30.03 
 
 
339 aa  85.9  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  30.03 
 
 
330 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  30.03 
 
 
339 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  27.02 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  30.82 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  28.92 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  31.25 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  27.21 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  27.21 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  26.55 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  25.7 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  30.38 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  27.9 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.69 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6456  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.25 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.379637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  28.47 
 
 
361 aa  79  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.8 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  28.77 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  28.91 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  29.39 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4875  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.35 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338198  normal  0.0605398 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.41 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.03 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1795  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.1 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.478026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>