More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0174 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0174  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
288 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1965  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
286 aa  188  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341692 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  32.29 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  33.88 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  33.88 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  33.88 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  33.88 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  33.88 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  33.88 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  33.16 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  34.29 
 
 
481 aa  72.4  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  33.61 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.9 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  33.61 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.31 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.37 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  30.29 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  24.02 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  31.09 
 
 
444 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  31.09 
 
 
444 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  31.09 
 
 
444 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
746 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  36.75 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.75 
 
 
1099 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  32.77 
 
 
442 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.88 
 
 
1115 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
1340 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  34.45 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.11 
 
 
351 aa  62.4  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
752 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.54 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.03 
 
 
700 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.11 
 
 
927 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.11 
 
 
1115 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.11 
 
 
1119 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
398 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.11 
 
 
1115 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  34.35 
 
 
872 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
1156 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  31.15 
 
 
424 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
357 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
370 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  29.05 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
1177 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
1177 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
386 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
369 aa  59.3  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  35.45 
 
 
309 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
333 aa  58.9  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
348 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.43 
 
 
337 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  32.79 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.33 
 
 
219 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  33.06 
 
 
425 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.79 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  33.06 
 
 
425 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
233 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
544 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
337 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.79 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
684 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  32.79 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
704 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  31.25 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>