31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1049 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  248  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  79.83 
 
 
120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  74.17 
 
 
120 aa  189  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  57.85 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  58.56 
 
 
124 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  53.15 
 
 
129 aa  136  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  57.02 
 
 
126 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  53.98 
 
 
122 aa  130  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  54.21 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  50.91 
 
 
113 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  47.71 
 
 
139 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  47.75 
 
 
113 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  46.09 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  43.69 
 
 
129 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  41.74 
 
 
128 aa  100  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  36.75 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  40.52 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  35.24 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  31.37 
 
 
118 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  29.73 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  26.67 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  32.98 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  28.81 
 
 
190 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  28.79 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  34.33 
 
 
205 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  36.51 
 
 
199 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  30.67 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3221  hypothetical protein  28.43 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>