More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1009 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  93.96 
 
 
331 aa  646    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  93.96 
 
 
331 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
331 aa  682    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
318 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.79 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.58 
 
 
312 aa  345  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  53.04 
 
 
313 aa  345  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  53.53 
 
 
311 aa  345  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.73 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.47 
 
 
308 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  52.3 
 
 
309 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  49.68 
 
 
313 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  54.15 
 
 
306 aa  329  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
307 aa  325  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.1 
 
 
313 aa  325  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
311 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  51.62 
 
 
316 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  50.49 
 
 
312 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
310 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
310 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  52.27 
 
 
313 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  51.32 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
310 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
311 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.13 
 
 
304 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  49.84 
 
 
312 aa  315  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.97 
 
 
310 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  49.23 
 
 
320 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  51.47 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.38 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.18 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  48.55 
 
 
314 aa  301  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.56 
 
 
313 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.23 
 
 
316 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.56 
 
 
313 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.56 
 
 
313 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  49 
 
 
310 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.01 
 
 
334 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.82 
 
 
335 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.25 
 
 
312 aa  295  6e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
312 aa  295  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.87 
 
 
336 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
318 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
328 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.18 
 
 
309 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.98 
 
 
334 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.1 
 
 
307 aa  293  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.09 
 
 
324 aa  292  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.98 
 
 
334 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.47 
 
 
317 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.73 
 
 
317 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
324 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  47.34 
 
 
329 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  46.33 
 
 
326 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  45.71 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.87 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.86 
 
 
334 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 
316 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.09 
 
 
310 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.23 
 
 
323 aa  287  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 
315 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.29 
 
 
334 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.6 
 
 
318 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 
315 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 
316 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
331 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.53 
 
 
315 aa  285  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.65 
 
 
338 aa  286  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  46.25 
 
 
313 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.65 
 
 
323 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.65 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.96 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.58 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  47.2 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.23 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.2 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2240  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.862655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  48.68 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.2 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.2 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.7 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.28 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.21 
 
 
328 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  46.5 
 
 
331 aa  281  9e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.98 
 
 
343 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
318 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.11 
 
 
333 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.15 
 
 
317 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.98 
 
 
343 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  44.04 
 
 
309 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.54 
 
 
306 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.98 
 
 
343 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.37 
 
 
307 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.98 
 
 
343 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>