More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0684 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0684  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1741  30S ribosomal protein S11  86.05 
 
 		 129 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.023772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0103  30S ribosomal protein S11  86.05 
 
 		 129 aa  206  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2233  30S ribosomal protein S11  86.05 
 
 		 129 aa  199  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  77.52 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  74.78 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2041  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  hitchhiker  0.00122216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  64.75 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  72.97 
 
 		 130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 132 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 131 aa  175  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  175  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  65.08 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 133 aa  173  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  63.93 
 
 		 130 aa  173  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  61.48 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  67.72 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 130 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 130 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  62.7 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  62.3 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 135 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  61.36 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 131 aa  168  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  63.11 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>