259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0638 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
406 aa  833    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
403 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
413 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
423 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
406 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
402 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  31.22 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  26.57 
 
 
407 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
406 aa  166  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
455 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
453 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
405 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
443 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
408 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  31.32 
 
 
407 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
407 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
407 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  30.67 
 
 
407 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
428 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
432 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
402 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  26.34 
 
 
415 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
420 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
413 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  27.74 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
417 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
425 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  25.81 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  27.54 
 
 
385 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
412 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
390 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
412 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
518 aa  123  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  26.99 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  24.09 
 
 
401 aa  99.4  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  40.95 
 
 
188 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  25.95 
 
 
369 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  40.95 
 
 
188 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.69 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.42 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.05 
 
 
383 aa  57  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.34 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  20.78 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.76 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
387 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
371 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  27.31 
 
 
452 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
322 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.19 
 
 
375 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  22.09 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  27.65 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  28.14 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  27.65 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  28.11 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
355 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
349 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
413 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  50.98 
 
 
387 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
375 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  30.08 
 
 
366 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.77 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 
374 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  23.83 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  33.7 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  26.67 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  19.63 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
359 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>