41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3351 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3351  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1265  bacteriophage DNA transposition B protein, putative  42.86 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01342e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0714  bacteriophage DNA transposition B protein  29.96 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  27.73 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2116  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  28.22 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2069  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  28.22 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00213879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0647  transposase protein B  29.36 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3753  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  27.55 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2908  bacteriophage DNA transposition B protein  29.02 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00692562  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4120  bacteriophage DNA transposition B protein  29.02 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1280  hypothetical protein  29.38 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2120  hypothetical protein  29.38 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0644  prophage MuSo1, DNA transposition protein, putative  25.94 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0071  ATP-binding protein  28.12 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.721813  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0221  ATP-binding protein  28.12 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123025 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2744  hypothetical protein  26.56 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2821  potential ATP-binding protein  26.56 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.804922  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3678  ATP-binding protein  26.52 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.478693 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3874  ATP-binding protein  26.52 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.634834 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4083  ATP-binding protein  26.52 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309906  normal  0.0721991 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4384  ATP-binding protein  26.15 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3367  transposase protein B  28.57 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0651  DNA transposition protein  30.33 
 
 		 314 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00310883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0786  DNA transposition protein  30.33 
 
 		 314 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000808918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  22.11 
 
 		 268 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  26.22 
 
 		 563 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0179  recombination factor protein RarA  25.87 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.88179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0346  ATP-binding protein  27.54 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  24.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  24.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 296 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1895  Uncharacterized ATPase putative transposase  25.97 
 
 		 283 aa  45.1  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292876  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  25.66 
 
 		 519 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.31 
 
 		 562 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  26.63 
 
 		 433 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  28.3 
 
 		 529 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  25 
 
 		 431 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  23.76 
 
 		 450 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  27.7 
 
 		 324 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  28.07 
 
 		 446 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2954  prophage MuMc02, transposition protein B  22.28 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>