28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2368 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 402 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  72.64 
 
 		 406 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  73.39 
 
 		 420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  31.02 
 
 		 520 aa  69.7  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  27.66 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  27.54 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  30.05 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  37.7 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  30.68 
 
 		 562 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  27.23 
 
 		 568 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  31.08 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  25.13 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  25.83 
 
 		 566 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  26.82 
 
 		 605 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 		 1188 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  26.78 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  23.94 
 
 		 568 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  26.09 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  25.63 
 
 		 566 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  27.65 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  31.07 
 
 		 563 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  28.48 
 
 		 666 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  25.21 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1062  von Willebrand factor type A  29.77 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  46.34 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0614  hypothetical protein  29.08 
 
 		 503 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  40.82 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>