More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2233 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2233  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00678182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1741  30S ribosomal protein S11  89.15 
 
 		 129 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.023772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0103  30S ribosomal protein S11  87.6 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  79.13 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0684  30S ribosomal protein S11  86.05 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2041  30S ribosomal protein S11  78.63 
 
 		 131 aa  192  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  hitchhiker  0.00122216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 		 131 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  185  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  65.87 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  67.21 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 130 aa  174  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  69.67 
 
 		 139 aa  173  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 128 aa  173  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  70.49 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  68.85 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3303  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  63.64 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  65.52 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  67.46 
 
 		 134 aa  166  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  59.69 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0444  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 128 aa  166  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>