More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2112 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2112  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0273695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.037759  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0247566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1856  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
174 aa  209  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0862  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
180 aa  201  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.353594  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1440  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
181 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2547  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.49891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
183 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 
183 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
174 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
183 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
175 aa  154  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
183 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
175 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1422  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
175 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351184  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1423  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
177 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0177502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
175 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
175 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
175 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
175 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
175 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
175 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
175 aa  151  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
177 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
176 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
186 aa  148  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
176 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
176 aa  148  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
190 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
174 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  42.42 
 
 
176 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
176 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
184 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3398  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
172 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
175 aa  144  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
177 aa  144  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
176 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1752  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
176 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
178 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
189 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
181 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0654  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
176 aa  143  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
189 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
180 aa  143  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
183 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
183 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
178 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
176 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_698  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 
182 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
181 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
190 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
181 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
183 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
181 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
186 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
181 aa  141  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
176 aa  141  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 
169 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
182 aa  141  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
184 aa  141  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
184 aa  140  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
178 aa  140  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
181 aa  140  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0189881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1764  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
175 aa  140  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
176 aa  140  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2046  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
184 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1746  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.477142  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
180 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
180 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
180 aa  138  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
180 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0718  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.25 
 
 
180 aa  137  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
178 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
178 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
178 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
178 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
178 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
178 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
181 aa  137  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1368  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
180 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>