More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1641 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  100 
 
 		 269 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  86.04 
 
 		 267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  74.81 
 
 		 266 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  75 
 
 		 266 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  75.69 
 
 		 257 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  75.1 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  75.1 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  77.12 
 
 		 271 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  76.03 
 
 		 274 aa  361  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  76.03 
 
 		 274 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  75 
 
 		 256 aa  358  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  73.22 
 
 		 255 aa  352  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  73.09 
 
 		 268 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 270 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  74.39 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  70.98 
 
 		 270 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  72.69 
 
 		 270 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  72.69 
 
 		 270 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  72.29 
 
 		 270 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  71.49 
 
 		 270 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  72.8 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  72.8 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  72.8 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  72.8 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  72.8 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  72.8 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  72.8 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  71.14 
 
 		 266 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  64.96 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  60.33 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  59.84 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  65.4 
 
 		 312 aa  281  9e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  61.25 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  62.82 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  56.97 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  60.5 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  56.92 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  57.66 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  58.75 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  59.26 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  57.61 
 
 		 277 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  54.34 
 
 		 288 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  59.66 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  56.15 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  55.79 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  55.37 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  61.44 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  58.4 
 
 		 333 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  58.08 
 
 		 319 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  58.08 
 
 		 319 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  59.22 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  52.76 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1209  ABC transporter related  54.81 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.89 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  58.89 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  59.32 
 
 		 275 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  60.08 
 
 		 319 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  57.14 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  55.13 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  57.5 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  53.82 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  56.92 
 
 		 278 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  55.04 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1668  ABC transporter related  61.97 
 
 		 320 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0241971  normal  0.174834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2845  ABC transporter related  58.33 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000305436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  54.77 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.75 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  44.86 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  45.68 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.15 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  49.78 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  50.67 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  50.67 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  48.68 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  50.67 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  49.55 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.78 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  45.89 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  49.78 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  49.78 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  46.5 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  49.78 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  48.5 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  47.48 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.08 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>