62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3366 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  92.26 
 
 
336 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  82.14 
 
 
336 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  81.25 
 
 
336 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  49.26 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  51.34 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  50 
 
 
337 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  50 
 
 
355 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  41.98 
 
 
344 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  45.08 
 
 
335 aa  263  2e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  43.12 
 
 
364 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  45.02 
 
 
341 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  39.94 
 
 
341 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  39.94 
 
 
341 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  42.14 
 
 
361 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  41.85 
 
 
341 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  42.14 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  42.14 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  42.81 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  41.3 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  42.46 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  42.46 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  42.46 
 
 
360 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  41.21 
 
 
361 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  40.61 
 
 
363 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  40.3 
 
 
361 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  42.28 
 
 
351 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  40.2 
 
 
355 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  42.81 
 
 
344 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  42.81 
 
 
361 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  42.81 
 
 
361 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  42.81 
 
 
361 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  42.81 
 
 
361 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  42.12 
 
 
361 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  42.47 
 
 
344 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  42.47 
 
 
361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  35.92 
 
 
329 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  37.82 
 
 
328 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  42.19 
 
 
330 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  41.13 
 
 
356 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  34.65 
 
 
354 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  34.82 
 
 
352 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  39.91 
 
 
343 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  30.99 
 
 
352 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  37.75 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  37.75 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  32.86 
 
 
412 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  32.14 
 
 
412 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  36.15 
 
 
418 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  30.71 
 
 
412 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  35.79 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.23 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  27.64 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  29.53 
 
 
376 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.53 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.53 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  30.39 
 
 
394 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  24.47 
 
 
542 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>