64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1228 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1228    100 
 
 		 854 bp  1693    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    85.15 
 
 		 1163 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  85.15 
 
 		 897 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    85.15 
 
 		 1163 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  85.15 
 
 		 816 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  85.15 
 
 		 807 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  85.15 
 
 		 867 bp  488  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  84.98 
 
 		 867 bp  480  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  84.98 
 
 		 867 bp  480  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    84.98 
 
 		 867 bp  480  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  84.98 
 
 		 867 bp  480  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  84.98 
 
 		 867 bp  480  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    85.01 
 
 		 868 bp  474  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    85.01 
 
 		 868 bp  474  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    84.84 
 
 		 868 bp  466  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    84.84 
 
 		 868 bp  466  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  84.65 
 
 		 867 bp  464  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  83.74 
 
 		 624 bp  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  84.73 
 
 		 585 bp  414  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0417    86.2 
 
 		 471 bp  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00057901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    84.41 
 
 		 834 bp  383  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  82.92 
 
 		 867 bp  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  82.76 
 
 		 867 bp  375  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3159    85.71 
 
 		 432 bp  357  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    82.54 
 
 		 561 bp  325  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    86.97 
 
 		 825 bp  313  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1240    86.19 
 
 		 333 bp  295  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0059    87.35 
 
 		 265 bp  234  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4877    86.11 
 
 		 216 bp  190  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.672818  hitchhiker  0.00547052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4664    87.3 
 
 		 216 bp  184  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4579    87.3 
 
 		 216 bp  184  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4298  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  97.33 
 
 		 171 bp  133  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0306  IS3 family element, transposase orfB  84.97 
 
 		 153 bp  121  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0261857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    94.81 
 
 		 540 bp  121  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0074    82.7 
 
 		 399 bp  113  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376988 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    90.24 
 
 		 641 bp  99.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    88.76 
 
 		 468 bp  97.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1151    97.92 
 
 		 48 bp  87.7  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1229    92.98 
 
 		 57 bp  81.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  81.88 
 
 		 528 bp  75.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4578    88.41 
 
 		 207 bp  73.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4663    88.41 
 
 		 207 bp  73.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    88.41 
 
 		 534 bp  73.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0213    81.98 
 
 		 250 bp  61.9  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  86.36 
 
 		 816 bp  60  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  86.36 
 
 		 816 bp  60  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  86.36 
 
 		 816 bp  60  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  86.36 
 
 		 816 bp  60  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  96.97 
 
 		 828 bp  58  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  96.97 
 
 		 828 bp  58  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  96.97 
 
 		 828 bp  58  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2341  Integrase catalytic region  94.29 
 
 		 810 bp  54  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  94.29 
 
 		 813 bp  54  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3141  hypothetical protein  86.79 
 
 		 240 bp  50.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>