More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1098 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  86.31 
 
 
266 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  83.46 
 
 
266 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  83.46 
 
 
266 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  81.54 
 
 
262 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  79.54 
 
 
262 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  79.92 
 
 
262 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  79.92 
 
 
262 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  69.41 
 
 
258 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  69.8 
 
 
258 aa  338  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  69.41 
 
 
259 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  69.8 
 
 
258 aa  337  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  69.53 
 
 
257 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  69.41 
 
 
258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  53.46 
 
 
261 aa  269  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  51.44 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  49.6 
 
 
253 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  47.35 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  41.04 
 
 
261 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  43.25 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  44.94 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  42.08 
 
 
260 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  39.68 
 
 
251 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  43.48 
 
 
258 aa  174  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  36.65 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  33.6 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 
265 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  40.16 
 
 
269 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  38.89 
 
 
249 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  33.2 
 
 
250 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  39.66 
 
 
279 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  34.96 
 
 
258 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  34.98 
 
 
262 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.39 
 
 
250 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  32.77 
 
 
275 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  32.4 
 
 
262 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  33.2 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.51 
 
 
267 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  37.45 
 
 
265 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  40.54 
 
 
264 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
274 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  33.73 
 
 
255 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  38.52 
 
 
267 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  34.75 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  33.6 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  36.93 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.53 
 
 
265 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
279 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  38.22 
 
 
282 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.95 
 
 
265 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  38.02 
 
 
286 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  36.29 
 
 
255 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  35.86 
 
 
255 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  39.27 
 
 
273 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.84 
 
 
255 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  35.89 
 
 
254 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
265 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
293 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.54 
 
 
265 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.54 
 
 
265 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  34.19 
 
 
257 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  35.54 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.54 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  35.54 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.54 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  36.32 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  34.98 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  36.36 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.69 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  37.07 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  32.92 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  34.27 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1169  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.89 
 
 
310 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  34.02 
 
 
255 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.54 
 
 
271 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  36.03 
 
 
276 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  37.34 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  34.56 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  33.73 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  35.85 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  36.11 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 
270 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 
270 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  31.93 
 
 
259 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.96 
 
 
268 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 
270 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.12 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  37.55 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
270 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  36.98 
 
 
284 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 
261 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>