More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1003 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  74.27 
 
 
241 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  70.12 
 
 
241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  69.71 
 
 
241 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  61.57 
 
 
243 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  61.57 
 
 
243 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  61.57 
 
 
243 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  65.29 
 
 
243 aa  305  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  59.09 
 
 
243 aa  297  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  59.09 
 
 
243 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  59.09 
 
 
243 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  59.09 
 
 
243 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  59.09 
 
 
243 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  58.26 
 
 
243 aa  294  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  58.68 
 
 
243 aa  294  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  58.26 
 
 
243 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  57.85 
 
 
243 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  57.85 
 
 
243 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  57.44 
 
 
243 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  57.44 
 
 
243 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  57.44 
 
 
243 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  57.02 
 
 
243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  55.83 
 
 
243 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  59.17 
 
 
245 aa  271  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  58.16 
 
 
242 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  55.19 
 
 
248 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  56.67 
 
 
240 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  55.85 
 
 
265 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  55.95 
 
 
254 aa  263  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  56.56 
 
 
242 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  54.94 
 
 
246 aa  262  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  56.02 
 
 
246 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  54.84 
 
 
244 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  54.32 
 
 
242 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  54.73 
 
 
242 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  54.32 
 
 
244 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  54.77 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  50.82 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  54.73 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  52.73 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  52.87 
 
 
244 aa  252  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  55.51 
 
 
244 aa  252  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  51.25 
 
 
242 aa  252  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  54.73 
 
 
244 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  56.85 
 
 
240 aa  250  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  52.28 
 
 
249 aa  250  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  55.6 
 
 
246 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  54.36 
 
 
246 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  52.11 
 
 
262 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  51.87 
 
 
242 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  54.72 
 
 
263 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  54.58 
 
 
243 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  51.72 
 
 
262 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  54.77 
 
 
246 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  56.2 
 
 
271 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  54.58 
 
 
254 aa  245  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  51.04 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  50 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  50 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  52.49 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  55.95 
 
 
229 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  50 
 
 
242 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  50.4 
 
 
261 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  52.26 
 
 
242 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  53.14 
 
 
247 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  54.85 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  54.85 
 
 
241 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1629  hypothetical protein  52.63 
 
 
267 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  56 
 
 
223 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  50.57 
 
 
278 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  50.57 
 
 
278 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  50.57 
 
 
278 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  50.57 
 
 
278 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  50.57 
 
 
275 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  49 
 
 
254 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  50 
 
 
283 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  53.5 
 
 
260 aa  228  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  52.02 
 
 
255 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  50.19 
 
 
278 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  48.12 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  50.19 
 
 
266 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  46.44 
 
 
239 aa  224  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  45.06 
 
 
260 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  46.61 
 
 
241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  46.61 
 
 
241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1918  protein of unknown function DUF152  49.81 
 
 
269 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396331  normal  0.0287676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  47.33 
 
 
247 aa  221  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  48.5 
 
 
279 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1590  protein of unknown function DUF152  49.43 
 
 
269 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.840086  normal  0.0159691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  50.99 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  49.62 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  49.61 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  46.99 
 
 
253 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  46.46 
 
 
260 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  51.95 
 
 
232 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  46.46 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  46.95 
 
 
268 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  50.61 
 
 
272 aa  214  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>